В химической промышленности это важное сырье для производства различных красителей и пигментов. Вещество также находит применение в процессах органического синтеза, где выступает в качестве компонента для получения промежуточных продуктов.
В лабораторной практике марганец сернокислый применяется для приготовления стандартных растворов марганца, используемых в аналитических целях. Вещество позволяет получать точные концентрации ионов марганца для различных исследований.